על פי החלטת הממשלה, בשנת הלימודים תשפ"ג ישתתפו בתוכנית הגמישות בתי ספר בחטיבה העליונה ובתי ספר בחינוך הרשמי ביסודי ובחטיבות הביניים. התוכנית אינה חלה בתשפ"ג על האוכלוסיות הבאות: גני ילדים, בתי ספר יסודיים וחטיבות ביניים במוכש"ר, מוסדות חינוך מיוחד, מרכזי מחוננים, בתי ספר בבתי חולים ומוסדות ייחודיים אחרים וכיתות י"ג-י"ד.

החל משנת הלימודים תשפ"ג בעקבות החלטה מס' 226 של הממשלה מיום 01.08.2021 בנושא "התוכנית לגמישות הניהולית במערכת החינוך", תורחב באופן משמעותי הגמישות הניהולית והפדגוגית של מנהלי בתי הספר והרשויות המקומיות, תוך העברת משאבים משמעותיים לניהולם הישיר.

בתי ספר שאינם משתתפים בתוכנית יוכלו לעשות שימוש במערכת גפ"ן לצורך מימוש מענים שונים שיונגשו להם במערכת במתכונת של "שוברים" ושרלוונטיים לכלל בתי הספר בשלבי חינוך אלו. כמו כן יוכלו אוכלוסיות אלו לקבל מענה במסגרת הסל הרשותי.

המערכת נפתחה ב-1.6.22 לשלב התכנון המלא, שבמהלכו על בתי הספר לתכנן במערכת את תקציב גפ"ן העומד לרשותם ולהציג את תוכנית העבודה הבית ספרית.